El arroyo Ayuí Grande es uno de los más importantes afluentes del Río Miriñay. Su curso se desarrolla con características de cuenca sedimeándrica, también sobre una llanura de inundación, con escasa pendiente, lo que povoca que en algunos lugares se formen bañados. En su curso inicial bordea los esteros del Pairiri por el este y los afluentes principales los recibe del sector occidental y son los arroyos Yuquerí y Curupicay. Toda su cuenca y su posterior fusión con el río Miriñay es alimentada por lluvias principalmente, y, secundariamente como aporte lateral, por aguas freáticas desde los macizos rocosos, a ambos lados del mismo. Estas selvas en galería poseen una abundante biodiversidad vegetal compuesta por muchas especies procedentes de la Selva Paranaense y otras típicas del la bio-región Chaco Húmedo. Entre la fauna mayor podemos mencionar al Ciervo de los Pantanos, al Lobito de Río, al Carpincho, y al Aguará Guazó. La avifauna presenta en esta zona una ámplia variedad superando las cuatrocientas especies, con poblaciones muy numerosas.